A síntese de AFP fetal ocorre no fígado, no saco vitelino e no trato gastrointestinal. A AFP produzida pelo feto é secretada no soro fetal, atinge um pico na 13ª semana de gestação e, em seguida, cai gradualmente durante a gestação. Logo depois do nascimento, o nível de APF do recém-nascido atinge o nível adulto normal. Nos adultos, as concentrações de AFP no soro permanecem baixas, exceto durante a gravidez, em doenças benignas do fígado (hepatite, cirrose), carcinoma hepatocelular primário e em certos tumores das células germinativas.