Os anticorpos anti-TPO ( Anti-Microssomal) geralmente são encontrados em conjunto com anti-Tg (Anticorpos anti-tireoglobulina) na maioria dos casos de tireoidite de Hashimoto, Mixedema Primário e doença de Graves. É comum encontrar anticorpos anti-TPO na ausência de auto-anticorpos para tireoglobulina. Diferentemente, os auto-anticorpos para a tiroglobulina não parecem ser patogênicos e podem simplesmente ser indicadores da doença. Os anti-Tg são associados aos casos hipotiroidismo ou hipertireoidismo moderados. Pacientes com outras doenças auto-imunes como Artrite Reumatóide e Diabetes Tipo I frequentemente apresentam auto-anticorpos anti-TPO e anti-Tg, além de que anti-TPO pode ser encontrado em pacientes com Doença de Addison e anti-Tg em pacientes com Anemia Perniciosa. Os anti-Tg são detectados em 30-60% dos casos de pacientes com carcinoma da tireóide. Além do mais os anticorpos anti-TPO e anti-Tg também são detectados em níveis baixos em até 20% dos indivíduos assintomáticos, particularmente nos idosos e mais frequentemente nas mulheres do que nos homens, embora a importância clínica destes auto-anticorpos não esteja clara.